Můžeme využít tři následující metody výzkumu
Sledování organismů v přirozené situaci pomocí přístrojů (lupa, dalekohled,...)
Mikroskop - dělíme podle velikosti
Makroskopická velikost - viditelná okem
Mikroskopická velikost - viditelná světelným mikroskopem
Submikroskopická velikost - viditelná elektronkovým mikroskopem
Sledování organismů v navozených podmínkách
Sledování objektů na předem daných organismech